akatsuki
Akatsuki je malá organizace nejvyšší úrovně. Organizace má nanejvýš deset členů a nepřesné množství agentů. Ačkoli má slušnou síť agentů v různých vesnicích, tito jedinci jsou obvykle ovládáni nějakou technikou. Členové Akatsuki jsou všichni z třídy S, a jsou to nejhledanější a nebezpeční ninjové.
Konan je jediná žena v zabijácké organizaci s názvem akatsuki. Do téhle organizace se nejspíše dostala s jejím nejvyšším velitelem, Peinem (Nagatem), který je současně i jejím přítelem a teamovým partnerem.
Není objasněno, z jaké vesnice Konan pochází, jelikož nikdy neukazuje svou ninja pásku. Ale pravděpodobně pochází ze stejné vesnice jako Pein (Nagato) a to z Vesnice ukryté v dešti (Amegakure no Sato). Lidé v této vesnici jí však neříkali Konan, nýbrž "Boží Anděl", jelikož byla Peinovou (Nagatovou) přítelkyní a Pein (Nagato) měl takovou moc, že ho obyvatelé považovali za boha.
Konan se v manze poprvé vyskytla ve 372 kapitole, když Jiraya šel zabít Peina (Nagata) a narazil na Konan, které se pomocí Gama Yudan (žabí olej) rychle zbavil (zalepil ji olejem a tím jí znemožnil používat její papírové jutsu).
Nyní Konan Peinovi (Nagatovi) pomáhá s úkolem, který jim uložil Madara Uchiha.
Habata itara modoranai to itte.
mezashita no wa aoi aoi ano sora,
kanashimi wa mada oboerarezu.
secunaisa wa ima tsukami hajimeta.
Anata e to idaku kono kanjo mo.
Ima kotoba ni kawatteiku.
Michinaru sekai no yume kara mezamete,
kono hane o hiroge tobidatsu!
Habata itara modoranai to itte.
Mezashita no wa aoi aoi ano sora
tsukinuketara mitsukaru to shitte.
Furukiru hodo aoi aoi ano sora,
aoi aoi ano sora,aoi aoi ano sora!
Akatsuki šéf je tajuplná osoba z vesnice ukryté v dešti. Jmenuje se Pein(Pain), ale nikdo z ostatných členov Akatsuki ho neoslovuje po mene na miesto toho ho jednoducho volajú "šéf". Jeho tvár nie je skoro nikdy ukázana. Má rešpekt u väčšiny členov (Hidan je výnimka). Ovláda tiež Fuuin Jutsu: Genryuu Kyuu Fuujin, ktoré zapečatí demona do sochy. Tiež používa ( 象転の術 Shouten no Jutsu) prenášač myšlienok.
Juugo (重吾) byl původním zdrojem a experimentem prokleté pečeti Orochimaru. Juugo má schopnost změnit a posílit své tělo. Bohužel tyto schopnosti nebyly pod jeho kontrolou, když začal ztrácet sám nad sebou kontrolu, tak se stal zabijáckým strojem a to i přesto, že on sám nikomu nechtěl ublížit. Z tohoto důvodu vyhledal Orochimaru, protože doufal, že takový ninja jako on by mu mohl pomoci.
Kakuzu (角都) je členem organizace Akatsuki a také hledaný ninja z Vesnice ukryté ve vodopádu (滝隠れの里, Takigakure no Sato). I když je členem Akatsuki, Kakuzu nesnáší fakt, že musí mít nějakého společníka. Protože se velmi rychle dokáže rozčílit, má ve zvyku zabíjet každého v dosahu, když je rozzuřený. Takhle už zabil mnoho svých předešlých týmových společníků a právě proto mu byl přidělen jako další partner Hidan, kterého nelze zabít.
Yuura (由良) byl Jounin ve Skryté Písečné vesnici a nevědomky byl pod nadvládou člena akatsuki Sasoriho. Také zasedal s Kazekagem v koncilu Písečné vesnice a vydržel tam čtyři roky.
Zetsu se dá snadno poznat díky dvěma velkým zeleným výčnělkům, které obklopují jeho hlavu. Tyto výčnělky pokračují zřejmě i na zbytku jeho těla a proto má vzhled jako rostlina. Když se jeho výčnělky poprvé otevřely, tak bylo vidět že Zetsu má dvě různé barevné půlky těla. Levou stranu má zcela bílou a pravou zcela černou. Černá tvář mluví v manze v japonské Katakaně a bílá v Kanji a Kaně. V anime má každá jeho půlka jiný dabing. Tyto dvě půky mezi sebou komunikují a občas se liší v názorech.
Oba se považují za umělce, avšak jejich úhly pohledu na to, co je „pravým uměním“ jsou diametrálně odlišné. Deidara prosazuje názor, že umění je pomíjivým, krátkým, ale intezivním zážitkem. Oproti tomu Sasori věří, že výjimečná umělecká díla by měla přetrvat jako odkaz do budoucna. Jejich postoje tak v podstatě odrážejí jejich náturu (Deidara vytváří hliněné, explodující skulptury a Sasori zas dlouhotrvající lidské loutky).
Hoshigaki Kisame (干柿鬼鮫) je jeden z vysoce nebezpečných zločinců třídy S a člen Akatsuki. Je také bývalým členem Sedmi šermířů z Mlžné (霧の忍刀七人衆), což je skupina ninjů, kteří mají velké a mocné zbraně. Když byl ještě v Mlžné, tak znal Hoozukiho Suigetsu a jeho bratra. Dříve než Kisame vstoupil do Akatsuki, tak byl Jouninem ve Skryté Mlžné, ale zavraždil Feudálního pána, proto se ho jeho bývalá vesnice snaží najít.